Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf628Q8CJ78 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Znf628Q8CJ78 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Znf628Q8CJ78 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Znf628Q8CJ78 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Znf628Q8CJ78 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Znf628Q8CJ78 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf628Q8CJ78 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Znf628Q8CJ78 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Znf628Q8CJ78 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Znf628Q8CJ78 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Znf628Q8CJ78 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Znf628Q8CJ78 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Znf628Q8CJ78 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Znf628Q8CJ78 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Znf628Q8CJ78 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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