Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH77

Nav1, Neuron navigator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nav1Q8CH77 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nav1Q8CH77 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nav1Q8CH77 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nav1Q8CH77 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nav1Q8CH77 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nav1Q8CH77 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nav1Q8CH77 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nav1Q8CH77 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nav1Q8CH77 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nav1Q8CH77 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nav1Q8CH77 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nav1Q8CH77 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nav1Q8CH77 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nav1Q8CH77 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nav1Q8CH77 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nav1Q8CH77 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Nav1Q8CH77 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nav1Q8CH77 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nav1Q8CH77 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nav1Q8CH77 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nav1Q8CH77 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nav1Q8CH77 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nav1Q8CH77 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nav1Q8CH77 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nav1Q8CH77 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nav1Q8CH77 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nav1Q8CH77 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nav1Q8CH77 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nav1Q8CH77 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nav1Q8CH77 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nav1Q8CH77 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nav1Q8CH77 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nav1Q8CH77 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nav1Q8CH77 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nav1Q8CH77 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nav1Q8CH77 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nav1Q8CH77 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Nav1Q8CH77 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nav1Q8CH77 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nav1Q8CH77 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nav1Q8CH77 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nav1Q8CH77 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nav1Q8CH77 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nav1Q8CH77 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nav1Q8CH77 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nav1Q8CH77 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nav1Q8CH77 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nav1Q8CH77 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nav1Q8CH77 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nav1Q8CH77 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nav1Q8CH77 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nav1Q8CH77 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nav1Q8CH77 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nav1Q8CH77 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nav1Q8CH77 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nav1Q8CH77 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nav1Q8CH77 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nav1Q8CH77 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nav1Q8CH77 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nav1Q8CH77 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nav1Q8CH77 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nav1Q8CH77 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nav1Q8CH77 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nav1Q8CH77 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nav1Q8CH77 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nav1Q8CH77 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms