Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Setd1bQ8CFT2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Setd1bQ8CFT2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Setd1bQ8CFT2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Setd1bQ8CFT2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Setd1bQ8CFT2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Setd1bQ8CFT2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Setd1bQ8CFT2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Setd1bQ8CFT2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Setd1bQ8CFT2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Setd1bQ8CFT2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Setd1bQ8CFT2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Setd1bQ8CFT2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Setd1bQ8CFT2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Setd1bQ8CFT2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Setd1bQ8CFT2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Setd1bQ8CFT2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Setd1bQ8CFT2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Setd1bQ8CFT2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Setd1bQ8CFT2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Setd1bQ8CFT2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Setd1bQ8CFT2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Setd1bQ8CFT2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Setd1bQ8CFT2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Setd1bQ8CFT2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Setd1bQ8CFT2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Setd1bQ8CFT2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.05
Setd1bQ8CFT2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Setd1bQ8CFT2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Setd1bQ8CFT2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Setd1bQ8CFT2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Setd1bQ8CFT2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Setd1bQ8CFT2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Setd1bQ8CFT2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Setd1bQ8CFT2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Setd1bQ8CFT2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Setd1bQ8CFT2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Setd1bQ8CFT2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Setd1bQ8CFT2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Setd1bQ8CFT2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Setd1bQ8CFT2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Setd1bQ8CFT2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Setd1bQ8CFT2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Setd1bQ8CFT2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms