Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kdm4aQ8BW72 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kdm4aQ8BW72 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms