Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK84

Dupd1, Dual specificity phosphatase DUPD1, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dupd1Q8BK84 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Dupd1Q8BK84 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms