Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc38a9Q8BGD6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms