Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Actr5Q80US4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Actr5Q80US4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms