Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cep170bQ80U49 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cep170bQ80U49 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cep170bQ80U49 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cep170bQ80U49 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cep170bQ80U49 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cep170bQ80U49 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cep170bQ80U49 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cep170bQ80U49 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cep170bQ80U49 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cep170bQ80U49 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cep170bQ80U49 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cep170bQ80U49 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cep170bQ80U49 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cep170bQ80U49 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cep170bQ80U49 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cep170bQ80U49 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cep170bQ80U49 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cep170bQ80U49 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Cep170bQ80U49 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cep170bQ80U49 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cep170bQ80U49 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cep170bQ80U49 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cep170bQ80U49 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cep170bQ80U49 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms