Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube2q1Q7TSS2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube2q1Q7TSS2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube2q1Q7TSS2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms