Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Actn1Q7TPR4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Actn1Q7TPR4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms