Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU7

Letm2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm2Q7TNU7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Letm2Q7TNU7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Letm2Q7TNU7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Letm2Q7TNU7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Letm2Q7TNU7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Letm2Q7TNU7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Letm2Q7TNU7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Letm2Q7TNU7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Letm2Q7TNU7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Letm2Q7TNU7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Letm2Q7TNU7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms