Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zc3h4Q6ZPZ3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zc3h4Q6ZPZ3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zc3h4Q6ZPZ3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zc3h4Q6ZPZ3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zc3h4Q6ZPZ3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zc3h4Q6ZPZ3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zc3h4Q6ZPZ3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zc3h4Q6ZPZ3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Zc3h4Q6ZPZ3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zc3h4Q6ZPZ3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zc3h4Q6ZPZ3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zc3h4Q6ZPZ3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zc3h4Q6ZPZ3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zc3h4Q6ZPZ3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zc3h4Q6ZPZ3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zc3h4Q6ZPZ3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zc3h4Q6ZPZ3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zc3h4Q6ZPZ3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zc3h4Q6ZPZ3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zc3h4Q6ZPZ3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zc3h4Q6ZPZ3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Zc3h4Q6ZPZ3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zc3h4Q6ZPZ3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms