Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms