Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Frem2Q6NVD0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frem2Q6NVD0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms