Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ltn1Q6A009 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ltn1Q6A009 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ltn1Q6A009 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ltn1Q6A009 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ltn1Q6A009 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ltn1Q6A009 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ltn1Q6A009 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ltn1Q6A009 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ltn1Q6A009 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ltn1Q6A009 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ltn1Q6A009 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ltn1Q6A009 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ltn1Q6A009 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ltn1Q6A009 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ltn1Q6A009 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ltn1Q6A009 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ltn1Q6A009 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ltn1Q6A009 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ltn1Q6A009 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ltn1Q6A009 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ltn1Q6A009 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ltn1Q6A009 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ltn1Q6A009 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ltn1Q6A009 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ltn1Q6A009 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ltn1Q6A009 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms