Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sin3bQ62141 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sin3bQ62141 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms