Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Npm1Q61937 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Npm1Q61937 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Npm1Q61937 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Npm1Q61937 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Npm1Q61937 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Npm1Q61937 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Npm1Q61937 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Npm1Q61937 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Npm1Q61937 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Npm1Q61937 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Npm1Q61937 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Npm1Q61937 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Npm1Q61937 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Npm1Q61937 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Npm1Q61937 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Npm1Q61937 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Npm1Q61937 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Npm1Q61937 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Npm1Q61937 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Npm1Q61937 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Npm1Q61937 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Npm1Q61937 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Npm1Q61937 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Npm1Q61937 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Npm1Q61937 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Npm1Q61937 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Npm1Q61937 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Npm1Q61937 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Npm1Q61937 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Npm1Q61937 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Npm1Q61937 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Npm1Q61937 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Npm1Q61937 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Npm1Q61937 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Npm1Q61937 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Npm1Q61937 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Npm1Q61937 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Npm1Q61937 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Npm1Q61937 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Npm1Q61937 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Npm1Q61937 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Npm1Q61937 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Npm1Q61937 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Npm1Q61937 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Npm1Q61937 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Npm1Q61937 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Npm1Q61937 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Npm1Q61937 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Npm1Q61937 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Npm1Q61937 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Npm1Q61937 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Npm1Q61937 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Npm1Q61937 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Npm1Q61937 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Npm1Q61937 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Npm1Q61937 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Npm1Q61937 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Npm1Q61937 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Npm1Q61937 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Npm1Q61937 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Npm1Q61937 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Npm1Q61937 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Npm1Q61937 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Npm1Q61937 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Npm1Q61937 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Npm1Q61937 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Npm1Q61937 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Npm1Q61937 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Npm1Q61937 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Npm1Q61937 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Npm1Q61937 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Npm1Q61937 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Npm1Q61937 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Npm1Q61937 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Npm1Q61937 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Npm1Q61937 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Npm1Q61937 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Npm1Q61937 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Npm1Q61937 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Npm1Q61937 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Npm1Q61937 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Npm1Q61937 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Npm1Q61937 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Npm1Q61937 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Npm1Q61937 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Npm1Q61937 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Npm1Q61937 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Npm1Q61937 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Npm1Q61937 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Npm1Q61937 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Npm1Q61937 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Npm1Q61937 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Npm1Q61937 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Npm1Q61937 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Npm1Q61937 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Npm1Q61937 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Npm1Q61937 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Npm1Q61937 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Npm1Q61937 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms