Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stxbp3Q60770 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms