Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atf3Q60765 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Atf3Q60765 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atf3Q60765 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atf3Q60765 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atf3Q60765 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atf3Q60765 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atf3Q60765 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atf3Q60765 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atf3Q60765 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atf3Q60765 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atf3Q60765 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atf3Q60765 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atf3Q60765 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atf3Q60765 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atf3Q60765 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atf3Q60765 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atf3Q60765 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atf3Q60765 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atf3Q60765 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atf3Q60765 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atf3Q60765 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atf3Q60765 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atf3Q60765 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atf3Q60765 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atf3Q60765 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atf3Q60765 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atf3Q60765 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atf3Q60765 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atf3Q60765 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atf3Q60765 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atf3Q60765 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atf3Q60765 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Atf3Q60765 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atf3Q60765 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Atf3Q60765 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Atf3Q60765 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atf3Q60765 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atf3Q60765 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atf3Q60765 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atf3Q60765 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atf3Q60765 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atf3Q60765 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atf3Q60765 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atf3Q60765 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atf3Q60765 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atf3Q60765 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atf3Q60765 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atf3Q60765 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atf3Q60765 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atf3Q60765 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atf3Q60765 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atf3Q60765 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atf3Q60765 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atf3Q60765 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atf3Q60765 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atf3Q60765 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atf3Q60765 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Atf3Q60765 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atf3Q60765 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atf3Q60765 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atf3Q60765 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms