Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp20Q5XG71 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp20Q5XG71 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp20Q5XG71 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp20Q5XG71 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp20Q5XG71 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp20Q5XG71 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp20Q5XG71 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp20Q5XG71 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp20Q5XG71 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp20Q5XG71 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp20Q5XG71 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp20Q5XG71 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp20Q5XG71 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp20Q5XG71 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp20Q5XG71 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms