Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med13Q5SWW4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med13Q5SWW4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med13Q5SWW4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med13Q5SWW4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med13Q5SWW4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med13Q5SWW4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med13Q5SWW4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med13Q5SWW4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med13Q5SWW4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med13Q5SWW4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Med13Q5SWW4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Med13Q5SWW4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Med13Q5SWW4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Med13Q5SWW4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Med13Q5SWW4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med13Q5SWW4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Med13Q5SWW4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms