Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chsy3Q5DTK1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms