Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms