Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Acsf3Q3URE1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms