Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gse1Q3U3C9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gse1Q3U3C9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gse1Q3U3C9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gse1Q3U3C9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gse1Q3U3C9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gse1Q3U3C9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gse1Q3U3C9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gse1Q3U3C9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gse1Q3U3C9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gse1Q3U3C9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gse1Q3U3C9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gse1Q3U3C9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gse1Q3U3C9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gse1Q3U3C9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gse1Q3U3C9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gse1Q3U3C9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gse1Q3U3C9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gse1Q3U3C9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gse1Q3U3C9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gse1Q3U3C9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gse1Q3U3C9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gse1Q3U3C9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gse1Q3U3C9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gse1Q3U3C9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gse1Q3U3C9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gse1Q3U3C9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms