Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Smarca4Q3TKT4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
Smarca4Q3TKT4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Smarca4Q3TKT4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Smarca4Q3TKT4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Smarca4Q3TKT4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Smarca4Q3TKT4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Smarca4Q3TKT4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
Smarca4Q3TKT4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Smarca4Q3TKT4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
Smarca4Q3TKT4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Smarca4Q3TKT4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
Smarca4Q3TKT4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Smarca4Q3TKT4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Smarca4Q3TKT4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Smarca4Q3TKT4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Smarca4Q3TKT4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Smarca4Q3TKT4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Smarca4Q3TKT4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Smarca4Q3TKT4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Smarca4Q3TKT4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Smarca4Q3TKT4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Smarca4Q3TKT4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Smarca4Q3TKT4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Smarca4Q3TKT4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Smarca4Q3TKT4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Smarca4Q3TKT4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Smarca4Q3TKT4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Smarca4Q3TKT4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Smarca4Q3TKT4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Smarca4Q3TKT4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Smarca4Q3TKT4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Smarca4Q3TKT4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Smarca4Q3TKT4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Smarca4Q3TKT4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Smarca4Q3TKT4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
Smarca4Q3TKT4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Smarca4Q3TKT4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Smarca4Q3TKT4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Smarca4Q3TKT4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Smarca4Q3TKT4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Smarca4Q3TKT4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Smarca4Q3TKT4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Smarca4Q3TKT4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
Smarca4Q3TKT4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Smarca4Q3TKT4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Smarca4Q3TKT4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Smarca4Q3TKT4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Smarca4Q3TKT4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Smarca4Q3TKT4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Smarca4Q3TKT4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Smarca4Q3TKT4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Smarca4Q3TKT4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Smarca4Q3TKT4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Smarca4Q3TKT4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Smarca4Q3TKT4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Smarca4Q3TKT4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Smarca4Q3TKT4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Smarca4Q3TKT4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Smarca4Q3TKT4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Smarca4Q3TKT4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Smarca4Q3TKT4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Smarca4Q3TKT4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Smarca4Q3TKT4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Smarca4Q3TKT4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Smarca4Q3TKT4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Smarca4Q3TKT4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Smarca4Q3TKT4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Smarca4Q3TKT4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Smarca4Q3TKT4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Smarca4Q3TKT4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Smarca4Q3TKT4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Smarca4Q3TKT4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms