Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grin2cQ01098 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grin2cQ01098 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms