Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lama4P97927 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lama4P97927 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lama4P97927 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lama4P97927 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lama4P97927 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lama4P97927 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lama4P97927 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lama4P97927 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lama4P97927 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lama4P97927 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lama4P97927 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lama4P97927 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lama4P97927 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lama4P97927 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lama4P97927 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Lama4P97927 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lama4P97927 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lama4P97927 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lama4P97927 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lama4P97927 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lama4P97927 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lama4P97927 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lama4P97927 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lama4P97927 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Lama4P97927 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lama4P97927 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Lama4P97927 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lama4P97927 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lama4P97927 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lama4P97927 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lama4P97927 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lama4P97927 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lama4P97927 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lama4P97927 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lama4P97927 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lama4P97927 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lama4P97927 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms