Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lig3P97386 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lig3P97386 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lig3P97386 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lig3P97386 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lig3P97386 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lig3P97386 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lig3P97386 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lig3P97386 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms