Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Acta1P68134 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Acta1P68134 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Acta1P68134 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Acta1P68134 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Acta1P68134 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acta1P68134 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms