Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps27aP62983 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
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