Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arf6P62331 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arf6P62331 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arf6P62331 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Arf6P62331 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arf6P62331 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arf6P62331 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Arf6P62331 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arf6P62331 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arf6P62331 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf6P62331 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arf6P62331 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms