Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Depdc5P61460 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Depdc5P61460 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Depdc5P61460 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Depdc5P61460 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Depdc5P61460 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Depdc5P61460 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Depdc5P61460 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Depdc5P61460 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Depdc5P61460 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Depdc5P61460 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Depdc5P61460 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Depdc5P61460 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Depdc5P61460 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Depdc5P61460 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Depdc5P61460 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Depdc5P61460 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Depdc5P61460 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Depdc5P61460 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Depdc5P61460 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Depdc5P61460 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Depdc5P61460 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Depdc5P61460 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Depdc5P61460 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Depdc5P61460 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Depdc5P61460 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Depdc5P61460 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Depdc5P61460 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Depdc5P61460 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Depdc5P61460 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Depdc5P61460 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Depdc5P61460 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Depdc5P61460 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Depdc5P61460 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
Depdc5P61460 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.77
Depdc5P61460 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
Depdc5P61460 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Depdc5P61460 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Depdc5P61460 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Depdc5P61460 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Depdc5P61460 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Depdc5P61460 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Depdc5P61460 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Depdc5P61460 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Depdc5P61460 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Depdc5P61460 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Depdc5P61460 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Depdc5P61460 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Depdc5P61460 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Depdc5P61460 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Depdc5P61460 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Depdc5P61460 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Depdc5P61460 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Depdc5P61460 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Depdc5P61460 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Depdc5P61460 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Depdc5P61460 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Depdc5P61460 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Depdc5P61460 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Depdc5P61460 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Depdc5P61460 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Depdc5P61460 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Depdc5P61460 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
Depdc5P61460 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Depdc5P61460 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms