Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PlnP61014 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PlnP61014 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PlnP61014 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PlnP61014 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PlnP61014 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PlnP61014 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PlnP61014 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PlnP61014 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PlnP61014 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PlnP61014 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PlnP61014 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PlnP61014 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PlnP61014 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PlnP61014 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PlnP61014 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PlnP61014 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PlnP61014 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PlnP61014 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PlnP61014 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PlnP61014 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PlnP61014 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PlnP61014 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PlnP61014 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PlnP61014 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PlnP61014 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PlnP61014 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PlnP61014 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PlnP61014 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PlnP61014 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PlnP61014 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PlnP61014 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PlnP61014 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PlnP61014 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PlnP61014 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PlnP61014 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PlnP61014 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PlnP61014 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PlnP61014 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PlnP61014 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PlnP61014 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PlnP61014 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PlnP61014 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PlnP61014 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PlnP61014 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PlnP61014 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PlnP61014 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PlnP61014 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PlnP61014 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PlnP61014 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PlnP61014 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PlnP61014 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PlnP61014 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PlnP61014 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PlnP61014 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PlnP61014 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PlnP61014 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PlnP61014 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PlnP61014 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PlnP61014 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PlnP61014 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PlnP61014 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PlnP61014 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PlnP61014 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PlnP61014 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PlnP61014 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PlnP61014 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PlnP61014 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PlnP61014 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PlnP61014 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PlnP61014 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PlnP61014 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PlnP61014 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PlnP61014 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PlnP61014 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PlnP61014 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PlnP61014 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PlnP61014 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PlnP61014 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PlnP61014 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PlnP61014 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PlnP61014 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PlnP61014 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PlnP61014 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PlnP61014 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PlnP61014 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PlnP61014 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PlnP61014 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PlnP61014 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PlnP61014 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PlnP61014 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PlnP61014 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PlnP61014 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PlnP61014 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PlnP61014 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PlnP61014 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PlnP61014 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PlnP61014 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PlnP61014 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PlnP61014 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms