Protein–RNA interactions for Protein: P60882

Megf8, Multiple epidermal growth factor-like domains protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 2,789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Megf8P60882 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Megf8P60882 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Megf8P60882 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Megf8P60882 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Megf8P60882 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Megf8P60882 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Megf8P60882 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Megf8P60882 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Megf8P60882 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Megf8P60882 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Megf8P60882 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Megf8P60882 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Megf8P60882 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Megf8P60882 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Megf8P60882 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Megf8P60882 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Megf8P60882 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Megf8P60882 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Megf8P60882 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Megf8P60882 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Megf8P60882 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Megf8P60882 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Megf8P60882 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Megf8P60882 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Megf8P60882 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Megf8P60882 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Megf8P60882 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Megf8P60882 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Megf8P60882 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Megf8P60882 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Megf8P60882 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Megf8P60882 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Megf8P60882 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Megf8P60882 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Megf8P60882 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Megf8P60882 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Megf8P60882 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Megf8P60882 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Megf8P60882 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Megf8P60882 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Megf8P60882 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Megf8P60882 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Megf8P60882 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Megf8P60882 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Megf8P60882 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Megf8P60882 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Megf8P60882 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Megf8P60882 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Megf8P60882 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Megf8P60882 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms