Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hps5P59438 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hps5P59438 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps5P59438 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps5P59438 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hps5P59438 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hps5P59438 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hps5P59438 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps5P59438 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hps5P59438 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hps5P59438 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hps5P59438 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms