Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cux1P53564 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cux1P53564 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cux1P53564 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cux1P53564 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cux1P53564 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cux1P53564 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cux1P53564 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Cux1P53564 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cux1P53564 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cux1P53564 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cux1P53564 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cux1P53564 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Cux1P53564 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cux1P53564 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cux1P53564 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cux1P53564 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cux1P53564 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cux1P53564 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cux1P53564 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cux1P53564 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cux1P53564 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cux1P53564 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cux1P53564 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cux1P53564 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cux1P53564 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cux1P53564 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cux1P53564 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cux1P53564 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cux1P53564 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cux1P53564 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cux1P53564 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Cux1P53564 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cux1P53564 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cux1P53564 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cux1P53564 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cux1P53564 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cux1P53564 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cux1P53564 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cux1P53564 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cux1P53564 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cux1P53564 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cux1P53564 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cux1P53564 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cux1P53564 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cux1P53564 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cux1P53564 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cux1P53564 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cux1P53564 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cux1P53564 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cux1P53564 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cux1P53564 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cux1P53564 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cux1P53564 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Cux1P53564 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Cux1P53564 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cux1P53564 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cux1P53564 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cux1P53564 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cux1P53564 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cux1P53564 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Cux1P53564 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cux1P53564 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cux1P53564 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cux1P53564 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cux1P53564 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cux1P53564 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cux1P53564 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cux1P53564 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cux1P53564 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cux1P53564 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cux1P53564 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cux1P53564 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms