Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Defa-rs12P50716 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Defa-rs12P50716 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Defa-rs12P50716 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Defa-rs12P50716 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Defa-rs12P50716 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Defa-rs12P50716 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Defa-rs12P50716 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Defa-rs12P50716 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Defa-rs12P50716 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Defa-rs12P50716 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Defa-rs12P50716 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Defa-rs12P50716 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Defa-rs12P50716 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Defa-rs12P50716 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Defa-rs12P50716 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defa-rs12P50716 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defa-rs12P50716 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defa-rs12P50716 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defa-rs12P50716 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Defa-rs12P50716 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defa-rs12P50716 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defa-rs12P50716 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Defa-rs12P50716 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Defa-rs12P50716 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defa-rs12P50716 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Defa-rs12P50716 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Defa-rs12P50716 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Defa-rs12P50716 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Defa-rs12P50716 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Defa-rs12P50716 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Defa-rs12P50716 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms