Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pbx1P41778 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms