Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik2P39087 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik2P39087 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik2P39087 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Grik2P39087 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grik2P39087 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grik2P39087 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grik2P39087 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grik2P39087 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik2P39087 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik2P39087 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik2P39087 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik2P39087 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik2P39087 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik2P39087 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms