Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp12P34960 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms