Protein–RNA interactions for Protein: P20612

Gnat1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnat1P20612 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gnat1P20612 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gnat1P20612 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gnat1P20612 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gnat1P20612 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gnat1P20612 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gnat1P20612 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gnat1P20612 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gnat1P20612 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gnat1P20612 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gnat1P20612 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gnat1P20612 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gnat1P20612 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gnat1P20612 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gnat1P20612 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gnat1P20612 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gnat1P20612 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gnat1P20612 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gnat1P20612 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms