Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VimP20152 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VimP20152 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VimP20152 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VimP20152 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VimP20152 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VimP20152 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VimP20152 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VimP20152 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VimP20152 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VimP20152 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VimP20152 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VimP20152 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VimP20152 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VimP20152 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VimP20152 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VimP20152 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VimP20152 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VimP20152 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VimP20152 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VimP20152 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VimP20152 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VimP20152 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VimP20152 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VimP20152 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VimP20152 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VimP20152 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VimP20152 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VimP20152 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VimP20152 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VimP20152 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VimP20152 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VimP20152 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VimP20152 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VimP20152 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VimP20152 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VimP20152 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VimP20152 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VimP20152 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VimP20152 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VimP20152 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VimP20152 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VimP20152 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VimP20152 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VimP20152 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VimP20152 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VimP20152 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VimP20152 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VimP20152 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VimP20152 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VimP20152 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VimP20152 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VimP20152 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VimP20152 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VimP20152 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VimP20152 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VimP20152 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VimP20152 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VimP20152 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VimP20152 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VimP20152 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VimP20152 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VimP20152 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VimP20152 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VimP20152 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VimP20152 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VimP20152 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VimP20152 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VimP20152 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VimP20152 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VimP20152 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VimP20152 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VimP20152 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VimP20152 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VimP20152 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VimP20152 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VimP20152 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VimP20152 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VimP20152 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VimP20152 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VimP20152 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VimP20152 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VimP20152 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VimP20152 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VimP20152 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VimP20152 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VimP20152 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VimP20152 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VimP20152 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VimP20152 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VimP20152 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VimP20152 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VimP20152 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VimP20152 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VimP20152 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VimP20152 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VimP20152 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VimP20152 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VimP20152 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VimP20152 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms