Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rag1P15919 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rag1P15919 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rag1P15919 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rag1P15919 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rag1P15919 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rag1P15919 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rag1P15919 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms