Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Dnmt1P13864 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Dnmt1P13864 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Dnmt1P13864 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Dnmt1P13864 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Dnmt1P13864 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Dnmt1P13864 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Dnmt1P13864 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Dnmt1P13864 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Dnmt1P13864 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Dnmt1P13864 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Dnmt1P13864 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Dnmt1P13864 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Dnmt1P13864 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Dnmt1P13864 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Dnmt1P13864 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Dnmt1P13864 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Dnmt1P13864 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Dnmt1P13864 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Dnmt1P13864 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Dnmt1P13864 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Dnmt1P13864 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Dnmt1P13864 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Dnmt1P13864 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Dnmt1P13864 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Dnmt1P13864 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Dnmt1P13864 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Dnmt1P13864 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Dnmt1P13864 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Dnmt1P13864 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Dnmt1P13864 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Dnmt1P13864 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Dnmt1P13864 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Dnmt1P13864 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Dnmt1P13864 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Dnmt1P13864 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Dnmt1P13864 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Dnmt1P13864 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Dnmt1P13864 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Dnmt1P13864 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Dnmt1P13864 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Dnmt1P13864 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Dnmt1P13864 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Dnmt1P13864 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Dnmt1P13864 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Dnmt1P13864 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Dnmt1P13864 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Dnmt1P13864 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Dnmt1P13864 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Dnmt1P13864 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Dnmt1P13864 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Dnmt1P13864 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Dnmt1P13864 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Dnmt1P13864 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Dnmt1P13864 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Dnmt1P13864 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Dnmt1P13864 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Dnmt1P13864 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Dnmt1P13864 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Dnmt1P13864 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Dnmt1P13864 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Dnmt1P13864 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Dnmt1P13864 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Dnmt1P13864 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
Dnmt1P13864 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Dnmt1P13864 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Dnmt1P13864 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Dnmt1P13864 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Dnmt1P13864 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Dnmt1P13864 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Dnmt1P13864 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Dnmt1P13864 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Dnmt1P13864 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Dnmt1P13864 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Dnmt1P13864 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Dnmt1P13864 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Dnmt1P13864 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Dnmt1P13864 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Dnmt1P13864 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Dnmt1P13864 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Dnmt1P13864 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Dnmt1P13864 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Dnmt1P13864 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Dnmt1P13864 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Dnmt1P13864 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Dnmt1P13864 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Dnmt1P13864 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Dnmt1P13864 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Dnmt1P13864 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Dnmt1P13864 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms