Protein–RNA interactions for Protein: P06334

T-cell receptor gamma chain C region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06334 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06334 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06334 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06334 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06334 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06334 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06334 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06334 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06334 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06334 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06334 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06334 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06334 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06334 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06334 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06334 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06334 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06334 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06334 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06334 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06334 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06334 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P06334 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P06334 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06334 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06334 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06334 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06334 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06334 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06334 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06334 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06334 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06334 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06334 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06334 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06334 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06334 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P06334 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06334 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06334 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06334 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06334 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06334 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06334 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06334 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06334 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06334 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06334 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06334 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06334 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06334 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P06334 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06334 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P06334 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06334 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06334 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06334 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06334 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06334 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06334 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06334 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P06334 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06334 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06334 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06334 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06334 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P06334 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P06334 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P06334 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P06334 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P06334 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P06334 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P06334 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06334 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P06334 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06334 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06334 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06334 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06334 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P06334 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06334 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06334 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06334 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06334 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06334 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06334 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06334 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06334 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06334 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06334 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06334 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06334 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06334 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06334 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06334 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06334 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06334 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06334 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06334 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06334 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms