Protein–RNA interactions for Protein: O88532

Zfr, Zinc finger RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfrO88532 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZfrO88532 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZfrO88532 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZfrO88532 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZfrO88532 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZfrO88532 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZfrO88532 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZfrO88532 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZfrO88532 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZfrO88532 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZfrO88532 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZfrO88532 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZfrO88532 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZfrO88532 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZfrO88532 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms