Protein–RNA interactions for Protein: J3QNW5

Gm21797, Predicted gene, 21797, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21797J3QNW5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21797J3QNW5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm21797J3QNW5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21797J3QNW5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21797J3QNW5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21797J3QNW5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21797J3QNW5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21797J3QNW5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21797J3QNW5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21797J3QNW5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21797J3QNW5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21797J3QNW5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21797J3QNW5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21797J3QNW5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21797J3QNW5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21797J3QNW5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21797J3QNW5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21797J3QNW5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21797J3QNW5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21797J3QNW5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms