Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Crocc2F6XLV1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
Crocc2F6XLV1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Crocc2F6XLV1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Crocc2F6XLV1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Crocc2F6XLV1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Crocc2F6XLV1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Crocc2F6XLV1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Crocc2F6XLV1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Crocc2F6XLV1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Crocc2F6XLV1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Crocc2F6XLV1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Crocc2F6XLV1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Crocc2F6XLV1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Crocc2F6XLV1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Crocc2F6XLV1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Crocc2F6XLV1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Crocc2F6XLV1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Crocc2F6XLV1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Crocc2F6XLV1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Crocc2F6XLV1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Crocc2F6XLV1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Crocc2F6XLV1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Crocc2F6XLV1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Crocc2F6XLV1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Crocc2F6XLV1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Crocc2F6XLV1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Crocc2F6XLV1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Crocc2F6XLV1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Crocc2F6XLV1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Crocc2F6XLV1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Crocc2F6XLV1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Crocc2F6XLV1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Crocc2F6XLV1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Crocc2F6XLV1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Crocc2F6XLV1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Crocc2F6XLV1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Crocc2F6XLV1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Crocc2F6XLV1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Crocc2F6XLV1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Crocc2F6XLV1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Crocc2F6XLV1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Crocc2F6XLV1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Crocc2F6XLV1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Crocc2F6XLV1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Crocc2F6XLV1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Crocc2F6XLV1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Crocc2F6XLV1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Crocc2F6XLV1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Crocc2F6XLV1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Crocc2F6XLV1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Crocc2F6XLV1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Crocc2F6XLV1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Crocc2F6XLV1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Crocc2F6XLV1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Crocc2F6XLV1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Crocc2F6XLV1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Crocc2F6XLV1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Crocc2F6XLV1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Crocc2F6XLV1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Crocc2F6XLV1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Crocc2F6XLV1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Crocc2F6XLV1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Crocc2F6XLV1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Crocc2F6XLV1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Crocc2F6XLV1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Crocc2F6XLV1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Crocc2F6XLV1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms