Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.57■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Simc1E9Q6E9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Simc1E9Q6E9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms